Історичний шлях науково-дослідного управління розвитку спеціальних систем та інновацій Житомирського військового інституту імені С. П. Корольова розпочався зі створення науково-дослідної лабораторії з проблем радіотехнічного озброєння військ протиповітряної оборони. Дану науково-дослідну лабораторію 21 квітня 1998 року було трансформовано в науково-дослідний відділ.

Директивою Міністра оборони України від 18.11.2003 року № 115/01/013 науково-дослідний відділ було розширено до науково-дослідного управління Житомирського військового інституту радіоелектроніки імені С. П. Корольова. 

Зважаючи на вагомі науково-практичні досягнення, отримані колективом науково-дослідного управління в галузях розроблення і застосування радіоелектронних та інформаційних систем військового призначення, у 2007 році цей науковий підрозділ реорганізовано в науковий центр Житомирського військового інституту імені С. П. Корольова.

У 2025 році після проведених організаційно-штатних змін науковий підрозділ Житомирського військового інституту імені С.П.Корольова було реорганізовано у науково-дослідне управління розвитку спеціальних систем та інновацій.

Основними напрямками наукових досліджень науково-дослідного управління розвитку спеціальних систем та інновацій, відповідно до наказу Міністерства оборони України “Про затвердження Розподілу основних напрямів наукових досліджень між науковими установами, вищими військовими навчальними закладами, військовими навчальними підрозділами закладів вищої освіти, є:
   

• Форми та способи застосування військових частин (підрозділів) радіоелектронної розвідки, радіоелектронної та кіберборотьби, безпілотних систем, протидії технічним розвідкам, психологічних операцій, спеціального радіозв’язку на тактичному рівні, інноваційний розвиток їх спроможностей.

• Система підготовки особового складу, військових частин (підрозділів) та органів управління радіоелектронної розвідки, радіоелектронної та кіберборотьби, безпілотних систем, протидії технічним розвідкам, психологічних операцій, спеціального радіозв’язку.

• Засоби (системи, комплекси) радіоелектронної розвідки, радіоелектронної та кіберборотьби, безпілотних систем, протидії технічним розвідкам, спеціального радіозв’язку, геофізичного контролю.

• Космічна підтримка Збройних Сил.

• Інформаційна боротьба та кібербезпека.

• Скрите управління військами.

Із перших днів війни російської федерації проти України особовий склад науково-дослідного управління розвитку спеціальних систем та інновацій приймає безпосередню участь у здійсненні заходів із забезпечення національної безпеки і оборони, відсічі та стримування збройної агресії російської федерації відповідно до напрямків діяльності науково-дослідного управління розвитку спеціальних систем та інновацій.

Практичні науково-технічні результати, отримані в науково-дослідному управлінні розвитку спеціальних систем та інновацій Житомирського військового інституту імені С. П. Корольова, перевіряються та використовуються у ході ведення бойових дій під час відбиття збройної агресії російської федерації.

До складу науково-дослідного управління розвитку спеціальних систем та інновацій Житомирського військового інституту імені С. П. Корольова входять профільні науково-дослідні відділи, в яких працюють 2 доктори наук та 14 кандидатів наук (докторів філософії).